Anthropic připsal Claudovi nález enzymového systému s neznámou funkcí

Anthropic 23. září oznámil, že Claude při průzkumu databází DNA upozornil na dosud nepopsanou rodinu reverzních transkriptáz. To jsou enzymy, které přepisují RNA do DNA. Vedle genu pro enzym leží pole opakujících se úseků a další gen s neznámou funkcí. Tým celek pojmenoval array-associated reverse transcriptases, zkráceně ART.

Slovo „systém“ tu neznamená hotový nástroj pro úpravu genů. Autoři v technické zprávě píšou, že funkci ART zatím neznají. Potvrdili, že se pole DNA přepisuje do krátkých RNA a že k enzymu patří sousední protein. Jak spolu tyto tři části pracují, zůstává hypotézou. Zpráva je předběžná práce týmu Anthropicu, nikoli nezávisle zopakovaná studie.

Od 1,9 miliardy shluků k jednomu nečekanému vzoru

Výzkumníci dali agentům stručné zadání: hledat nové systémy reverzních transkriptáz podle genů v jejich okolí. Claude si sestavil vyhledávací profily, prošel 1,94 miliardy proteinových shluků a po filtrování ponechal 198 290 shluků reverzních transkriptáz. V jejich okolí napočítal 3 564 opakujících se rodin proteinů. Do hloubky zkoumal sedmnáct kandidátů a u tří potvrdil dosud nepopsané spojení.

Celá kampaň měla 119 úkolů, 949 relací agentů a spotřebovala 215,6 milionu tokenů. Součet práce agentů činil 77 hodin, protože běželi souběžně; podle hodin na zdi trvala kampaň 21,5 hodiny. Člověk během ní nezasahoval. Lidé však napsali původní zadání, vybrali kandidáty k další práci a provedli všechny laboratorní pokusy.

K ART nevedla hlavní větev hledání. Jeden agent nejprve zkoumal sousední gen virové RNA polymerázy, pak ho jako náhodnou souvislost odmítl. Přesto otevřel další úkol nad samotnou transkriptázou. Další agent načetl okolní DNA a všiml si čtrnácti kopií šestnáctinukleotidového motivu oddělených úseky dlouhými zhruba 100 až 200 nukleotidů.

Podobnost s CRISPR končí u uspořádání

Autoři našli 95 shluků příbuzných transkriptáz, převážně v genomech velkých bakteriofágů, tedy virů napadajících bakterie. U 28 z nich rozpoznali před enzymem opakující se pole. Jednotlivá pole mají tři až 21 opakování; mezi nimi leží navzájem odlišné mezery dlouhé 120 až 220 nukleotidů.

Uspořádání připomíná pole CRISPR, ale rozdíly jsou podstatné. Mezery v CRISPR bývají přibližně třicetinukleotidové a v okolí pracují geny cas. U ART autoři žádný cas nenašli. Zpráva proto netvrdí, že Claude objevil nový CRISPR ani nový nástroj pro editaci genů. Mluví o jiném typu nekódujícího opakujícího se prvku.

Ve veřejných datech z infekce bakterie Staphylococcus lentus fágem SA1 tvořily RNA odvozené z pole po patnácti minutách až 8 % RNA viru. Tým pak vložil systém SA1 do Escherichia coli a znovu pozoroval oddělené krátké RNA. Tím doložil, že pole není jen zvláštní zápis v databázi. Nedoložil však, zda systém DNA řeže, kopíruje, vkládá nebo dělá něco jiného.

Deset dalších kampaní stejný objev nezopakovalo

Největší výhrada stojí přímo v technické zprávě. Výzkumníci spustili stejnou kampaň ještě desetkrát. Většina běhů se k lokusům ART dostala a dva se rodinou zabývaly podrobněji, žádný agent si však nepřečetl DNA před enzymem. Opakující se pole proto všech deset běhů minulo.

Tým následně vytvořil jednodušší testy s předem vybranými sekvencemi. Když nejvýkonnější modely dostaly DNA přímo do kontextu, správně popsaly pole nejméně v 90 % pokusů. S více soubory, nástroji a literaturou úspěšnost u některých nastavení klesla až na 32 %. Ve 39 % pokusů se soubory si model nepřečetl ani souvislý úsek dlouhý 200 nukleotidů, takže celé opakování nemohl vidět.

Také hodnocení těchto testů dělal model Mythos 5 od Anthropicu podle deseti znaků, které vybral tým Anthropicu. Výsledek vypovídá o tom, jak se Claude chová v jejich připravené úloze. Nejde o nezávislý biologický test ani o důkaz, že stejnou anomálii najde v jiné databázi.

Odborná kritika míří na slovo objev

The Decoder oslovil Lucase Harringtona, spoluzakladatele firmy Mammoth Biosciences a někdejšího doktoranda Jennifer Doudnaové. Podle něj se obdobné prohledávání genomů používá desítky let a příbuzné systémy jsou známé od roku 2008. Za obtížnou část považuje určení skutečné funkce, kterou Anthropic zatím neukázal.

TechCrunch připomíná ještě hranici mezi modelem a laboratoří. Claude třídil sekvence a navrhoval vysvětlení, fyzické pokusy dělali lidé. Laboratoř pracuje v nižších režimech biologického zabezpečení BSL-1 a BSL-2 a podle Anthropicu nepoužívá patogeny schopné infikovat člověka. Firma mezitím zpřístupňuje biologům zvláštní režim s mírnějšími biologickými ochranami, ale tento výzkum popisuje jako vlastní laboratorní práci.

Nejlépe doloženým výsledkem proto není nový programovatelný nástroj. Je jím pracovní postup, ve kterém stovky agentních relací zúží miliardy záznamů na kandidáta pro lidskou laboratoř. Jestli ART přinese biotechnologické využití, ukážou až další pokusy a nezávislé zopakování.

Zdroje

• Anthropic, Claude discovers a novel enzyme system with CRISPR-like repeats, 23. září 2026
• Autonomous AI agents discover reverse transcriptases with tandem repeat arrays, předběžná technická zpráva týmu Anthropicu
• The Decoder, Anthropic says Claude discovered a new enzyme system, but CRISPR researchers call it routine genome mining, 24. září 2026
• TechCrunch, Anthropic says its biology lab has already found something big, 23. září 2026